Анализ на носительство возбудителей кишечных инфекций. Как делают анализ на брюшной тиф


Комплексное молекулярно-генетическое исследование, которое позволяет выявить генетический материал наиболее вероятных возбудителей острых кишечных инфекций в кале и установить этиологию заболевания.

Для чего используется этот анализ?

  • Для дифференциальной диагностики причин острой .

Когда назначается анализ?

  • При симптомах острой кишечной инфекции (диарея, лихорадка, ).

Синонимы русские

ОКИ, ПЦР (кал).

Синонимы английские

Acute intestinal infection screening; Bacterial and viral diarrhea screening, PCR, fecal samples.

Метод исследования

Полимеразная цепная реакция в режиме реального времени.

Какой биоматериал можно использовать для исследования?

Как правильно подготовиться к исследованию?

  • Исследование рекомендуется проводить до начала приема антибиотиков и других антибактериальных химиотерапевтических препаратов.
  • Исключить прием слабительных препаратов, введение ректальных свечей, масел, ограничить прием медикаментов, влияющих на перистальтику кишечника (белладонна, пилокарпин и др.) и на окраску кала (железо, висмут, сернокислый барий), в течение 72 часов до сбора кала.

Общая информация об исследовании

Согласно официальной статистике, в России до 65-67 % заболеваний этой группы составляют ОКИ неуточненной этиологии. Если возбудитель инфекции неизвестен, эффективность противоэпидемических мероприятий ограничивается. Соотношение частоты выявления вирусных и бактериальных патогенов варьируется в разных возрастах: у детей до 3 лет на долю вирусных агентов приходится 80-90 % заболеваний, на долю бактериальных – 10-20 %; среди взрослых пациентов доля вирусных возбудителей снижается до 30 %.

Shigellaspecies и Esherichiacoli – грамотрицательные палочковидные микроорганизмы из семейства энтеробактерий. К роду Shigella относятся патогенные бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, которые являются возбудителями . Энтероинвазивные E. coli (EIEC) очень близки с шигеллами, синтезируют и выделяют шигеллоподобный токсин, способны проникать в клетки слизистой кишечника и разрушать энтероциты, что приводит к образованию язвенных дефектов в слизистой кишечника. За значительную часть случаев «бактериологически неподтвержденной дизентерии», особенно у детей, ответственен энтероинвазивный эшерихиоз.

Бактерии рода Salmonella относятся к семейству энтеробактерий. S. typhi и S. parathyphi являются возбудителями брюшного тифа и . Существует множество серовариантов Salmonella species, способных вызвать у человека инфекцию по типу гастроэнтероколита, а также стать причиной внутрибольничных инфекций. может протекать в форме острой кишечной инфекции, тяжелой генерализированной инфекции или бессимптомного носительства. Окончательный диагноз ставится только после выделения возбудителя или обнаружения его ДНК.

Кампилобактерии являются одними из наиболее сложных для культивирования (которое требуется в ходе анализа) микроорганизмов. Это объясняется их микроаэрофильностью и возможностью подавления их роста сопутствующей флорой. Род кампилобактерий объединяет как возбудителей ОКИ (термофильные виды), так и сапрофитные и условно-патогенные виды, о чем необходимо помнить при выявлении этих микроорганизмов в клиническом материале. Применение наборов на основе ПЦР для определения термофильной группы кампилобактерий позволяет не только избежать трудоемкой и высокозатратной бактериологической работы, но и четко ограничить детекцию тех видов кампилобактерий, которые имеют этиологическую связь с острой кишечной инфекцией (С. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

В соответствии с данными зарубежной литературы, норовирус – наиболее частый возбудитель вспышек ОКИ небактериальной этиологии. Эта особенность связана с низкой инфицирующей дозой и высокой устойчивостью в окружающей среде. ПЦР является «золотым стандартом» в клинической диагностике норовирусных инфекций.

Несмотря на несколько меньшую в сравнении с рота- и норовирусами распространенность, астровирусы составляют значительный пласт кишечных инфекций, у трети пациентов протекающий с явлениями колита. Ротавирусы группы А являются наиболее частой причиной спорадических заболеваний ОКИ у детей, а ДНК-содержащий аденовирус F (серотипы 40 и 41) нередко вызывает вспышки у детей младшего возраста.

Для выявления и дифференциальной диагностики кишечных инфекций используются культуральные и молекулярно-генетические методы исследования генетического материала возбудителя в кале и определение концентрации специфических иммуноглобулинов в крови. ПЦР обладает преимуществом перед культуральными методами благодаря быстрому получению результатов, высокой специфичности и чувствительности исследования. Данный анализ позволяет со 100-процентной точностью определить возбудителя кишечного заболевания, а быстрая диагностика острых кишечных инфекций помогает избежать лишних процедур и оперативных вмешательств, своевременно начать лечение и ограничить очаг распространения инфекции.

Для чего используется исследование?

  • Для установления этиологического фактора острой кишечной инфекции;
  • для дифференциальной диагностики причин острого гастроэнтероколита (воспаления ЖКТ).

Когда назначается исследование?

  • При симптомах острого гастроэнтерита, вероятно, инфекционной этиологии (жидкий частый стул, рвота, лихорадка, боли в животе);
  • при одновременном или последовательном развитии ОКИ у нескольких членов семьи, у детей в детском учреждении или пациентов в стационаре;
  • при подозрении на развитие внутрибольничной кишечной инфекции (при обострении симптомов энтероколита у пациента, находящегося на лечении по поводу ОКИ).

Что означают результаты?

Референсные значения: отрицательно.

Причины положительного результата:

  • присутствие ДНК или РНК возбудителя ОКИ; этиология в зависимости от выявленного вида возбудителя (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus).

Причины отрицательного результата:

  • отсутствие инфицирования Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus.

Что может влиять на результат?

Факторы, искажающие результат:

  • длительное хранение материала до его поступления в лабораторию;
  • замораживание материала или его термическая обработка;
  • несоблюдение правил взятия биоматериала и его загрязнение.

Важные замечания

Лабораторная диагностика брюшного тифа включает общеклинические методы исследования и специфические реакции. В результате комплексного обследования специалист сможет сделать заключение о тяжести заболевания, свойствах возбудителя (в том числе и чувствительности к антибиотикам), степени опасности пациента для окружающих (его заразности). Все необходимые исследования проводятся в начале болезни (при поступлении пациента в стационар) и перед выпиской. При необходимости анализ на брюшной тиф повторяется несколько раз.

Есть еще один важный нюанс: дифференциальная диагностика брюшного тифа и паратифов возможна только на основании специфического лабораторного обследования . Ни клинические детали, ни общеклинические методы диагностики не позволяют отличить от возбудителей паратифов А, С или В. Эта информация может иметь существенное значение с точки зрения возможного заражения окружающих, а также формирования только типоспецифического иммунитета.

Общая характеристика исследований

Где сдать анализ с целью диагностики брюшного тифа? Этот вопрос не должен беспокоить пациента, так как современные медицинские протоколы подразумевают обязательную госпитализацию больных с таким предварительным диагнозом. В крупных медицинских учреждениях (или в пределах одного города) функционирует многопрофильная лаборатория, сотрудники которой смогут сделать все необходимые специфические и неспецифические исследования для полноценной диагностики брюшного тифа и паратифов.

Универсального ответа на вопрос, через сколько дней пациент будет знать точный диагноз, не существует. Для проведения неспецифических исследований требуется только один день, результат специфических реакций придет только на 4-5 сутки или даже больше.

Выявление возбудителя брюшного тифа и паратифов является главным направлением комплексного обследования не только больного, но потенциальных носителей (здоровых людей, выделяющих возбудитель и заражающих окружающих). Результаты такого обследования заносятся в санитарную (медицинскую) книжку человека (декретированная специализированная группа), работающего в пищевой отрасли, в детских учреждениях и некоторых других предприятиях.

Для проведения различных диагностических тестов у больного (носителя) берут следующие биологические жидкости:

  • кровь;
  • каловые массы;
  • мочу;
  • желчь.

Необходимость взятия той или иной биологической среды пациента определяется лечащим доктором. С другой стороны, действовать нужно достаточно быстро, так как назначенные антибиотики снижают эффективность микробиологической диагностики брюшного тифа – биологические жидкости нужно брать до начала лечения.

Общеклинические методы

Стандартные процедуры, такие как общеклинический анализ крови и мочи, в данном случае действительно имеют диагностическую ценность, так как выявленные изменения очень характерны.

В общем анализе крови при тифо-паратифозных заболеваниях выявляются:

  • лейкоцитоз в первые 1-2 дня, который сменяется лейкопенией;
  • нехарактерные для бактериальной инфекции лимфоцитоз, тромбоцитопению, анэозинофилию;
  • в тяжелых случаях может наблюдаться панцитопения (угнетение функции всех кровяных ростков);
  • выявление эозинофилов в период выздоровления пациента является прогностически благоприятным признаком в течении болезни.

В общеклиническом анализе мочи выявляются традиционные изменения (повышение уровня лейкоцитов, эритроцитов), типичные для выраженной интоксикации.

При проведении общеклинического исследования кала (копрограмма) могут быть выявлены эритроциты, что свидетельствует о наличии незначительного кишечного кровотечения. Наряду с копрограммой принято назначать еще исследование кала на скрытую кровь, чтобы исключить диагностическую ошибку и своевременно диагностировать кровотечение.

В случае тифо-паратифозных заболеваний биохимические показатели исследуются только с целью выявления выраженных нарушений функций внутренних органов, например, при развитии специфического гепатита или пиелонефрита.

Специфические методы

Микробиологическая диагностика брюшного тифа является основанием для постановки окончательного диагноза и дальнейших противоэпидемических действий. При обследовании особых групп населения (декретированная группа) отметка об отрицательном результате исследования крови на брюшной тиф для санкнижки является допуском к рабочему месту. Специфический анализ на брюшной тиф включает бактериологическое и серологическое исследования.

Бактериологический метод

Предполагает взятие биологического материала от больного и последующий посев на специальные питательные среды (чаще всего – желчный бульон). Изучение морфологических, биохимических и многих других свойств микроорганизма позволяют со 100% точностью идентифицировать его. Кроме того, современная микробиология предусматривает такой обязательный этап как антибиотикочувствительность, без которой существенно затрудняется процесс эффективной противомикробной терапии.


Кровь на брюшной тиф лучше сдавать в первую неделю болезни. Положительный анализ крови на брюшной тиф, то есть положительная гемокультура – это абсолютное подтверждение диагноза. Обнаружение тифозной сальмонеллы в моче и каловых массах может наблюдаться в одинаковой степени у больного человека и носителя, то есть требуются другие дополнительный исследования.

Серологический метод

Основой множества реакций, реализующих серологический метод исследования, является соединение известного антигена (брюшнотифозного) и антител, которые синтезируются в крови больного. Серологическая диагностика брюшного тифа - это реакция Видаля, реакция непрямой гемагглютинации (РНГА), при необходимости – реакция с Vi – антигеном.

Реакция Видаля – это модификация реакции агглютинации, диагностическая ценность заключается в нарастании титра антител по мере течения заболевания. Эта реакция может быть ложноположительной при других сальмонеллезах, поэтому требуется и другая серодиагностика брюшного тифа. Например, более специфична РНГА с различными антигенами. Некоторые лаборатории проводят РПГА – реакцию пассивной агглютинации антител известными антигенами.

При подозрении на брюшной тиф диагностика специфическая позволяет подтвердить или опровергнуть диагноз этого инфекционного заболевания, а также, возможно, выяснить, откуда появилась эта инфекция.

  • Описание
  • Подготовка
  • Показания
  • Интерпретация результатов

Исследование используют в целях дифференциальной диагностики острых кишечных инфекций.

Состав профиля:
  • Shigella spp./Escherichia coli (Enteroinvasive Escherichia coli - EIEC)
  • Salmonella spp.
  • Campilobacter spp.
  • Adenovirus F
  • Rotavirus A
  • Norovirus GII
  • Astrovirus

Большая часть острых кишечных инфекций у детей (от 50 до 80% всех случаев заболеваний) обусловлена вирусными инфекциями, преимущественно вызванными ротавирусами группы А и норовирусом 2-ой геногруппы (GII). В структуре ОКИ бактериального происхождения наиболее часто встречающимися возбудителями у детей являются сальмонеллы. Наряду с сальмонеллезом (около 7% острых кишечных инфекций) актуальны эшерихиоз (4,8% ОКИ), кампилобактериоз (2,9% случаев заболеваний), шигеллез (0,3% случаев острых кишечных инфекций).

Бактериальная диарея, в отличие от вирусной, характеризуется более тяжелым клиническим течением, поскольку патофизиологические механизмы повреждения слизистой оболочки связаны с проникновением микроорганизмов в клетки эпителия и действием бактериальных эндотоксинов. При инвазивных (бактериальных) острых кишечных инфекциях бактериологический метод является «золотым стандартом» диагностики при соблюдении ключевого правила: взятие биоматериала должно проводиться до назначения антимикробной терапии (см. тесты №№457, 458, 460, 461, 462).

Молекулярно-генетические исследования (в т. ч. ПЦР-метод), выявляющие специфические фрагменты ДНК и РНК возбудителей в биоматериале, входят в стандартные схемы диагностики ОКИ и позволяют быстро и эффективно верифицировать комплекс вирусных и бактериальных возбудителей острых кишечных инфекций. Антигенные тесты идентификации возбудителей ОКИ (см. тесты №№463, 481, 482, 483, 485, 486) также являются экспресс-методами, дающими возможность установить диагноз бактериальной или вирусной острой кишечной инфекции на ранних сроках болезни, в том числе и на фоне лечения антибиотиками. Серологические методы, позволяющие обнаружить специфические антитела к возбудителям, являются вспомогательными в диагностике большинства инвазивных ОКИ (см. тесты №№234, 235, 238, 239, 273, 280-290, 292, 293).

  • дифференциальная диагностика острых кишечных инфекций.

Интерпретация результатов исследования содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Аналитическая чувствительность (фекалии):

  • Shigella spp./Escherichia coli (EIEC) - 1х103 ГЭ/мл
  • Salmonella spp. – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Campilobacter spp. – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Adenovirus F – 1х10 4 ГЭ/мл
  • Rotavirus A – 1х10 4 ГЭ/мл
  • Norovirus GII – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Astrovirus – 1х10 4 ГЭ/мл

Форма представления результата:

Тест качественный. Результат выдается в терминах «обнаружено» или «не обнаружено» по указанным возбудителям отдельно, кроме теста Shigella spp./Escherichia coli (EIEC), в котором присутствие ДНК этих возбудителей выявляется суммарно.


Интерпретация результатов

«Обнаружено»:
  • инфекция, вызванная соответствующим возбудителем;
  • носительство возбудителя инфекции.

«Не обнаружено»:

  • отсутствие ДНК (РНК) возбудителя в исследуемом материале;
  • уровень ДНК (РНК) возбудителя в исследуемом материале ниже предела детекции.

Литература

  • Вовк Е.И., Машарова А.А. Острые кишечные инфекции в практике врача скорой медицинской помощи. Лечащий врач. - М. 2002;01-02:58-62.
  • Инфекционные болезни у детей. Под ред. Д. Марри. - М.: Изд. «Практика». 2006:928.
  • Усенко Д.В., Плоскирева А.А., Горелов А.В. Острые кишечные инфекции у детей в практике педиатра: возможности диагностики и терапии. Вопросы современной педиатрии. - М. 2014;13(3):12-20. http://www.spr-journal.ru/ojs/index.php/VSP/article/viewFile/340/682.
  • Pawlowski S.W., Warren C.A., Guerrant R. Diagnosis and Treatment of Acute or Persistent Diarrhea. Gastroenterology. 2009;136(6):1874-1886.
  • Описание
  • Подготовка
  • Показания
  • Интерпретация результатов

Исследование используют в целях дифференциальной диагностики острых кишечных инфекций.

Состав профиля:
  • Shigella spp./Escherichia coli (Enteroinvasive Escherichia coli - EIEC)
  • Salmonella spp.
  • Campilobacter spp.
  • Adenovirus F
  • Rotavirus A
  • Norovirus GII
  • Astrovirus

Большая часть острых кишечных инфекций у детей (от 50 до 80% всех случаев заболеваний) обусловлена вирусными инфекциями, преимущественно вызванными ротавирусами группы А и норовирусом 2-ой геногруппы (GII). В структуре ОКИ бактериального происхождения наиболее часто встречающимися возбудителями у детей являются сальмонеллы. Наряду с сальмонеллезом (около 7% острых кишечных инфекций) актуальны эшерихиоз (4,8% ОКИ), кампилобактериоз (2,9% случаев заболеваний), шигеллез (0,3% случаев острых кишечных инфекций).

Бактериальная диарея, в отличие от вирусной, характеризуется более тяжелым клиническим течением, поскольку патофизиологические механизмы повреждения слизистой оболочки связаны с проникновением микроорганизмов в клетки эпителия и действием бактериальных эндотоксинов. При инвазивных (бактериальных) острых кишечных инфекциях бактериологический метод является «золотым стандартом» диагностики при соблюдении ключевого правила: взятие биоматериала должно проводиться до назначения антимикробной терапии (см. тесты №№457, 458, 460, 461, 462).

Молекулярно-генетические исследования (в т. ч. ПЦР-метод), выявляющие специфические фрагменты ДНК и РНК возбудителей в биоматериале, входят в стандартные схемы диагностики ОКИ и позволяют быстро и эффективно верифицировать комплекс вирусных и бактериальных возбудителей острых кишечных инфекций. Антигенные тесты идентификации возбудителей ОКИ (см. тесты №№463, 481, 482, 483, 485, 486) также являются экспресс-методами, дающими возможность установить диагноз бактериальной или вирусной острой кишечной инфекции на ранних сроках болезни, в том числе и на фоне лечения антибиотиками. Серологические методы, позволяющие обнаружить специфические антитела к возбудителям, являются вспомогательными в диагностике большинства инвазивных ОКИ (см. тесты №№234, 235, 238, 239, 273, 280-290, 292, 293).

  • дифференциальная диагностика острых кишечных инфекций.

Интерпретация результатов исследования содержит информацию для лечащего врача и не является диагнозом. Информацию из этого раздела нельзя использовать для самодиагностики и самолечения. Точный диагноз ставит врач, используя как результаты данного обследования, так и нужную информацию из других источников: анамнеза, результатов других обследований и т.д.

Аналитическая чувствительность (фекалии):

  • Shigella spp./Escherichia coli (EIEC) - 1х103 ГЭ/мл
  • Salmonella spp. – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Campilobacter spp. – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Adenovirus F – 1х10 4 ГЭ/мл
  • Rotavirus A – 1х10 4 ГЭ/мл
  • Norovirus GII – 1х10 3 ГЭ/мл
  • Astrovirus – 1х10 4 ГЭ/мл

Форма представления результата:

Тест качественный. Результат выдается в терминах «обнаружено» или «не обнаружено» по указанным возбудителям отдельно, кроме теста Shigella spp./Escherichia coli (EIEC), в котором присутствие ДНК этих возбудителей выявляется суммарно.


Интерпретация результатов

«Обнаружено»:
  • инфекция, вызванная соответствующим возбудителем;
  • носительство возбудителя инфекции.

«Не обнаружено»:

  • отсутствие ДНК (РНК) возбудителя в исследуемом материале;
  • уровень ДНК (РНК) возбудителя в исследуемом материале ниже предела детекции.

Литература

  • Вовк Е.И., Машарова А.А. Острые кишечные инфекции в практике врача скорой медицинской помощи. Лечащий врач. - М. 2002;01-02:58-62.
  • Инфекционные болезни у детей. Под ред. Д. Марри. - М.: Изд. «Практика». 2006:928.
  • Усенко Д.В., Плоскирева А.А., Горелов А.В. Острые кишечные инфекции у детей в практике педиатра: возможности диагностики и терапии. Вопросы современной педиатрии. - М. 2014;13(3):12-20. http://www.spr-journal.ru/ojs/index.php/VSP/article/viewFile/340/682.
  • Pawlowski S.W., Warren C.A., Guerrant R. Diagnosis and Treatment of Acute or Persistent Diarrhea. Gastroenterology. 2009;136(6):1874-1886.
Поделиться: