Анализ за носителство на патогени на чревни инфекции. Как се прави тест за коремен тиф?


Цялостно молекулярно-генетично изследване, което ви позволява да идентифицирате генетичния материал на най-вероятните патогени на остра чревни инфекциив изпражненията и установяване на етиологията на заболяването.

За какво се използва този анализ?

  • За диференциална диагноза на остри причини.

Кога е планиран анализ?

  • Със симптоми на остра чревна инфекция (диария, треска,).

Руски синоними

OKI, PCR (кал).

СинонимиАнглийски

Скрининг за остри чревни инфекции; Скрининг на бактериална и вирусна диария, PCR, фекални проби.

Изследователски метод

Полимеразна верижна реакция в реално време.

Какъв биоматериал може да се използва за изследване?

Как правилно да се подготвим за изследване?

  • Препоръчва се изследването да се проведе преди приема на антибиотици и други антибактериални химиотерапевтични лекарства.
  • Избягвайте приема на лаксативи ректални супозитории, масла, ограничаване на приема на лекарства, които влияят на чревната подвижност (беладона, пилокарпин и др.) и цвета на изпражненията (желязо, бисмут, бариев сулфат), в рамките на 72 часа преди събиране на изпражненията.

Обща информация за изследването

Според официалната статистика в Русия до 65-67% от заболяванията в тази група са остри чревни инфекции с неуточнена етиология. Ако причинителят на инфекцията е неизвестен, ефективността на противоепидемичните мерки е ограничена. Съотношението на честотата на откриване на вирусни и бактериални патогени варира в различни възрасти: при деца под 3 години вирусните агенти представляват 80-90% от заболяванията, бактериалните агенти представляват 10-20%; при възрастни пациенти делът на вирусните патогени е намален до 30%.

Shigellaspecies и Escherichiacoli са грам-отрицателни, пръчковидни микроорганизми от семейство Enterobacteriaceae. Родът Shigella включва патогенни бактерии S. dysenteriae, S. flexneri, S. boydii и S. sonnei, които са патогени. Ентероинвазивните Е. coli (EIEC) са много подобни на Shigella, те синтезират и отделят подобен на Shigella токсин, способни са да проникнат в клетките на чревната лигавица и да унищожат ентероцитите, което води до образуване на язвени дефекти в чревната лигавица . За значителна част от случаите на "бактериологично непотвърдена дизентерия", особено при деца, е отговорна ентероинвазивната ешерихиоза.

Бактериите от род Salmonella принадлежат към семейство Enterobacteriaceae. S. typhi и S. parathyphi са причинители на коремен тиф и. Има много сероварианти на видове Salmonella, които могат да причинят инфекция, подобна на гастроентероколит при хора, както и да причинят нозокомиални инфекции. може да се появи под формата на остра чревна инфекция, тежка генерализирана инфекция или асимптоматично носителство. Окончателната диагноза се поставя само след изолирането на патогена или откриването на неговата ДНК.

Campylobacter е един от най-трудните за култивиране (което се изисква по време на анализа) микроорганизми. Това се дължи на тяхната микроаерофилност и възможността за потискане на растежа им от съпътстващата флора. Родът Campylobacter съчетава както патогени на AII (термофилни видове), така и сапрофитни и опортюнистични видове, които трябва да се запомнят при идентифицирането на тези микроорганизми в клиничен материал. Използването на базирани на PCR комплекти за определяне на термофилната група на кампилобактер не само избягва трудоемката и скъпа бактериологична работа, но също така ясно ограничава откриването на тези видове кампилобактер, които имат етиологична връзка с острата чревна инфекция (C. jejuni, C. coli, C. lari, C. upsaliensis).

Според данни от чуждестранна литература норовирусът е най-честият причинител на огнища на AII с небактериална етиология. Тази характеристика е свързана с ниска инфекциозна доза и висока резистентност към околен свят. PCR е "златен стандарт" в клинична диагностиканоровирусни инфекции.

Въпреки малко по-ниското разпространение в сравнение с рота- и норовирусите, астровирусите представляват значителен слой от чревни инфекции, при една трета от пациентите, протичащи с колит. Ротавирусите от група А са най-много обща каузаспорадичен AII при деца, а ДНК-съдържащият аденовирус F (серотипове 40 и 41) често причинява огнища при малки деца.

За откриване и диференциална диагноза на чревни инфекции се използват културни и молекулярно-генетични методи за изследване на генетичния материал на патогена в изпражненията и определяне на концентрацията на специфични имуноглобулини в кръвта. PCR има предимство пред методите за култивиране поради бързо получаванерезултати, висока специфичност и чувствителност на изследването. Този анализви позволява да идентифицирате патогена със 100% точност заболяване на червата, а бързата диагностика на остри чревни инфекции помага да се избегнат ненужни процедури и хирургични интервенции, започнете своевременно лечение и ограничете фокуса на разпространението на инфекцията.

За какво се използват изследванията?

  • За установяване етиологичен факторостра чревна инфекция;
  • за диференциална диагноза на причините за остър гастроентероколит (възпаление на стомашно-чревния тракт).

Кога е насрочено изследването?

  • Със симптоми на остър гастроентерит, вероятно с инфекциозна етиология (редки чести изпражнения, повръщане, треска, коремна болка);
  • с едновременно или последователно развитие на остри чревни инфекции в няколко членове на семейството, при деца в детско заведениеили стационарни пациенти;
  • със съмнение за развитие на нозокомиална чревна инфекция (с обостряне на симптомите на ентероколит при пациент, лекуван за остри чревни инфекции).

Какво означават резултатите?

Референтни стойности:отрицателен.

Причини за положителен резултат:

  • наличието на ДНК или РНК на причинителя на AII; етиология в зависимост от идентифицирания тип патоген (Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus).

Причини за отрицателен резултат:

  • няма инфекция с Shigella spp., E. coli (EIEC), Salmonella spp., Campylobacter spp., Adenovirus F, Rotavirus A, Norovirus 2 генотип, Astrovirus.

Какво може да повлияе на резултата?

Фактори, изкривяващи резултата:

  • дългосрочно съхранение на материала, преди да влезе в лабораторията;
  • замразяване на материала или топлинна обработка;
  • неспазване на правилата за вземане на биоматериал и неговото замърсяване.

Важни бележки

Лабораторната диагностика на коремен тиф включва общи клинични методи на изследване и специфични реакции. В резултат на цялостен преглед специалистът ще може да направи заключение за тежестта на заболяването, свойствата на патогена (включително чувствителността към антибиотици), степента на опасност на пациента за другите (неговата заразност). Всички необходими изследвания се извършват в началото на заболяването (когато пациентът влезе в болницата) и преди изписването. При необходимост анализ за Коремен тифповторен няколко пъти.

Има още един важен нюанс: диференциална диагнозакоремен тиф и паратиф е възможно само въз основа на специфично лабораторно изследване. Нито клиничните детайли, нито общите клинични диагностични методи позволяват разграничаване на патогени от паратиф А, С или В. Тази информация може да бъде значима по отношение на възможна инфекция на други, както и формирането само на специфичен за типа имунитет.

Обща характеристика на изследването

Къде да вземете теста за диагностициране на коремен тиф? Този въпрос не трябва да притеснява пациента, тъй като съвременните медицински протоколи предполагат задължителна хоспитализация на пациенти с такава предварителна диагноза. В големи лечебни заведения(или в рамките на същия град) има мултидисциплинарна лаборатория, чиито служители ще могат да направят всички необходими специфични и неспецифични изследвания за пълна диагностика на коремен тиф и паратиф.

Няма универсален отговор на въпроса след колко дни пациентът ще разбере точната диагноза. За неспецифични изследвания е необходим само един ден, резултатът от специфичните реакции ще дойде само за 4-5 дни или дори повече.

Идентифицирането на причинителя на коремен тиф и паратиф е основната посока на цялостен преглед не само на пациента, но и на потенциалните носители ( здрави хоракоито освобождават патогена и заразяват другите). Резултатите от такъв преглед се вписват в санитарната (медицинска) книжка на лице (декларирана специализирана група), работещо в хранително-вкусовата промишленост, в детски институции и някои други предприятия.

За различни диагностични тестове от пациента (носителя) се вземат следните биологични течности:

  • кръв;
  • фекални маси;
  • урина;
  • жлъчката.

Необходимостта от приемане на определена биологична среда на пациента се определя от лекуващия лекар. От друга страна, трябва да действате достатъчно бързо, тъй като предписаните антибиотици намаляват ефективността микробиологична диагностикатиф - трябва да се вземат телесни течности преди започване на лечението.

Общи клинични методи

Стандартните процедури, като общ клиничен анализ на кръвта и урината, в този случай наистина имат диагностична стойност, тъй като идентифицираните промени са много характерни.

AT общ анализкръв при тиф-паратифни заболявания се откриват:

  • левкоцитоза през първите 1-2 дни, която се заменя с левкопения;
  • нехарактерно за бактериална инфекциялимфоцитоза, тромбоцитопения, анеозинофилия;
  • в тежки случаи може да се наблюдава панцитопения (потискане на функцията на всички кръвни кълнове);
  • откриването на еозинофили по време на периода на възстановяване на пациента е прогностично благоприятен знак в хода на заболяването.

В общия клиничен анализ на урината се откриват традиционни промени (повишени нива на левкоцити, еритроцити), характерни за тежка интоксикация.

При провеждане на общо клинично изследване на изпражненията (копрограма) могат да бъдат открити еритроцити, което показва наличието на незначително чревно кървене. Заедно с копрограмата е обичайно да се предписва друго изследване на изпражненията за окултна кръв, за да се изключи диагностична грешка и да се диагностицира своевременно кървене.

В случай на коремен тиф-паратиф, биохимичните параметри се изследват само за идентифициране на изразени дисфункции. вътрешни органи, например, с развитието на специфичен хепатит или пиелонефрит.

Специфични методи

Микробиологичната диагностика на коремния тиф е основа за окончателната диагноза и по-нататъшните противоепидемични действия. При изследване на специални групи от населението (декларирана група) маркировка за отрицателен резултат от кръвен тест за коремен тиф за санитарна книжка е допускане до работното място. Специфичният анализ за коремен тиф включва бактериологични и серологични изследвания.

Бактериологичен метод

Тя включва вземане на биологичен материал от пациента и последващо засяване върху специални медии за култура(най-често - жлъчен бульон). Изследването на морфологични, биохимични и много други свойства на микроорганизма ни позволява да го идентифицираме със 100% точност. В допълнение, съвременната микробиология предвижда такъв задължителен етап като антибиотична чувствителност, без който процесът на ефективна антимикробна терапия е значително затруднен.


По-добре е да дарите кръв за коремен тиф през първата седмица на заболяването.Положителният кръвен тест за коремен тиф, тоест положителната хемокултура, е абсолютно потвърждение на диагнозата. Откриване на тифна салмонела в урината и изпражненияможе да се наблюдава в еднаква степен при болен човек и носител, т.е. необходими са други допълнителни изследвания.

Серологичен метод

Основата на много реакции, които прилагат серологичния метод на изследване, е комбинацията от известен антиген (тиф) и антитела, които се синтезират в кръвта на пациента. Серологична диагностикатифът е реакция на Видал, реакция индиректна хемаглутинация(RNGA), при необходимост - реакция с Vi - антиген.

Реакция на Видал- това е модификация на реакцията на аглутинация, диагностичната стойност се състои в увеличаването на титъра на антителата с напредване на заболяването. Тази реакция може да бъде фалшиво положителна при друга салмонелоза, така че е необходима друга серодиагностика на коремен тиф. Например RNGA с различни антигени е по-специфичен. Някои лаборатории са RPGA- реакция на пасивна аглутинация на антитела с известни антигени.

Ако се подозира коремен тиф, специфичната диагностика може да потвърди или отхвърли диагнозата заразна болести също така евентуално да разберете откъде идва тази инфекция.

  • Описание
  • обучение
  • Показания
  • Тълкуване на резултатите

Изследването се използва за диференциална диагноза на остри чревни инфекции.

Състав на профила:
  • Shigella spp./Escherichia coli (Enteroinvasive Escherichia coli - EIEC)
  • Salmonella spp.
  • Campylobacter spp.
  • Аденовирус F
  • Ротавирус А
  • Норовирус GII
  • Астровирус

Повечето остри чревни инфекции при децата (от 50 до 80% от всички случаи на заболявания) се дължат на вирусни инфекции, причинени предимно от ротавируси от група А и норовирус от геногрупа 2 (GII). В структурата на острите чревни инфекции с бактериален произход най-честите причинители при децата са салмонелите. Наред със салмонелозата (около 7% от острите чревни инфекции), ешерихиозата (4,8% от острите чревни инфекции), кампилобактериозата (2,9% от случаите на заболявания), шигелозата (0,3% от случаите на остри чревни инфекции) са от значение.

Бактериалната диария е по-тежка от вирусната. клинично протичане, тъй като патофизиологичните механизми на увреждане на лигавицата са свързани с проникването на микроорганизми в епителните клетки и действието на бактериалните ендотоксини. При инвазивни (бактериални) остри чревни инфекции бактериологичният метод е "златен стандарт" за диагностика, при спазване на основното правило: биоматериалът трябва да се вземе преди назначаването на антимикробна терапия (виж тестове № 457, 458, 460, 461, 462). ).

Молекулярно-генетичните изследвания (включително PCR метода), които идентифицират специфични фрагменти от ДНК и РНК на патогени в биоматериала, са включени в стандартните схеми за диагностициране на AEI и ви позволяват бързо и ефективно да проверите комплекса от вирусни и бактериални патогени на остра чревни инфекции. Антигенните тестове за идентифициране на патогени на AII (вижте тестове № 463, 481, 482, 483, 485, 486) също са експресни методи, които позволяват да се установи диагноза на бактериална или вирусна остра чревна инфекция на ранни датизаболяване, включително антибиотично лечение. Серологичните методи, които позволяват откриването на специфични антитела към патогени, са спомагателни при диагностицирането на повечето инвазивни AII (виж тестове № 234, 235, 238, 239, 273, 280-290, 292, 293).

  • диференциална диагноза на остри чревни инфекции.

Тълкуването на резултатите от изследването съдържа информация за лекуващия лекар и не е диагноза. Информацията в този раздел не трябва да се използва за самодиагностика или самолечение. Точна диагнозапоставя лекаря да използва и двата резултата това проучване, и необходимата информацияот други източници: анамнеза, резултати от други изследвания и др.

Аналитична чувствителност (изпражнения):

  • Shigella spp./Escherichia coli (EIEC) - 1x103 GE/ml
  • Salmonella spp. – 1x10 3 GE/ml
  • Campylobacter spp. – 1x10 3 GE/ml
  • Аденовирус F - 1x10 4 GE/ml
  • Ротавирус А - 1x10 4 GE/ml
  • Норовирус GII - 1x10 3 GE/ml
  • Астровирус - 1x10 4 GE / ml

Форма за представяне на резултатите:

Тест за качество. Резултатът се дава като "открит" или "неоткрит" за посочените патогени поотделно, с изключение на теста Shigella spp./Escherichia coli (EIEC), при който наличието на ДНК на тези патогени се открива общо.


Тълкуване на резултатите

„Открит“:
  • инфекция, причинена от съответния патоген;
  • носителство на инфекциозния агент.

„Не е открито“:

  • липсата на ДНК (РНК) на патогена в тествания материал;
  • нивото на ДНК (РНК) на патогена в тестовия материал е под границата на откриване.

Литература

  • Вовк Е.И., Машарова А.А. Остри чревни инфекции в практиката на спешния лекар медицински грижи. Терапевт. - М. 2002; 01-02: 58-62.
  • инфекциозни заболяванияпри деца. Изд. Д. Мъри. - М.: Изд. "Практика". 2006:928.
  • Усенко Д.В., Плоскирева А.А., Горелов А.В. Остри чревни инфекции при деца в практиката на педиатър: възможности за диагностика и лечение. Въпроси на съвременната педиатрия. - М. 2014;13(3):12-20. http://www.spr-journal.ru/ojs/index.php/VSP/article/viewFile/340/682.
  • Pawlowski S.W., Warren C.A., Guerrant R. Диагностика и лечение на остра или персистираща диария. гастроентерология. 2009; 136 (6): 1874-1886.
  • Описание
  • обучение
  • Показания
  • Тълкуване на резултатите

Изследването се използва за диференциална диагноза на остри чревни инфекции.

Състав на профила:
  • Shigella spp./Escherichia coli (Enteroinvasive Escherichia coli - EIEC)
  • Salmonella spp.
  • Campylobacter spp.
  • Аденовирус F
  • Ротавирус А
  • Норовирус GII
  • Астровирус

Повечето остри чревни инфекции при деца (от 50 до 80% от всички случаи на заболявания) се причиняват от вирусни инфекции, причинени главно от ротавируси от група А и норовирус от 2-ра геногрупа (GII). В структурата на острите чревни инфекции с бактериален произход най-честите причинители при децата са салмонелите. Наред със салмонелозата (около 7% от острите чревни инфекции), ешерихиозата (4,8% от острите чревни инфекции), кампилобактериозата (2,9% от случаите на заболявания), шигелозата (0,3% от случаите на остри чревни инфекции) са от значение.

Бактериалната диария, за разлика от вирусната, се характеризира с по-тежък клиничен ход, тъй като патофизиологичните механизми на увреждане на лигавицата са свързани с проникването на микроорганизми в епителните клетки и действието на бактериалните ендотоксини. При инвазивни (бактериални) остри чревни инфекции бактериологичният метод е "златен стандарт" за диагностика, при спазване на основното правило: биоматериалът трябва да се вземе преди назначаването на антимикробна терапия (виж тестове № 457, 458, 460, 461, 462). ).

Молекулярно-генетичните изследвания (включително PCR метода), които идентифицират специфични фрагменти от ДНК и РНК на патогени в биоматериала, са включени в стандартните схеми за диагностициране на AEI и ви позволяват бързо и ефективно да проверите комплекса от вирусни и бактериални патогени на остра чревни инфекции. Антигенните тестове за идентифициране на патогени на AII (вижте тестове № 463, 481, 482, 483, 485, 486) също са експресни методи, които позволяват да се установи диагнозата на бактериална или вирусна остра чревна инфекция в ранните стадии на заболяването, включително на фона на антибиотично лечение. Серологичните методи, които позволяват откриването на специфични антитела към патогени, са спомагателни при диагностицирането на повечето инвазивни AII (виж тестове № 234, 235, 238, 239, 273, 280-290, 292, 293).

  • диференциална диагноза на остри чревни инфекции.

Тълкуването на резултатите от изследването съдържа информация за лекуващия лекар и не е диагноза. Информацията в този раздел не трябва да се използва за самодиагностика или самолечение. Точната диагноза се поставя от лекаря, като се използват както резултатите от това изследване, така и необходимата информация от други източници: история, резултати от други изследвания и др.

Аналитична чувствителност (изпражнения):

  • Shigella spp./Escherichia coli (EIEC) - 1x103 GE/ml
  • Salmonella spp. – 1x10 3 GE/ml
  • Campylobacter spp. – 1x10 3 GE/ml
  • Аденовирус F - 1x10 4 GE/ml
  • Ротавирус А - 1x10 4 GE/ml
  • Норовирус GII - 1x10 3 GE/ml
  • Астровирус - 1x10 4 GE / ml

Форма за представяне на резултатите:

Тест за качество. Резултатът се дава като "открит" или "неоткрит" за посочените патогени поотделно, с изключение на теста Shigella spp./Escherichia coli (EIEC), при който наличието на ДНК на тези патогени се открива общо.


Тълкуване на резултатите

„Открит“:
  • инфекция, причинена от съответния патоген;
  • носителство на инфекциозния агент.

„Не е открито“:

  • липсата на ДНК (РНК) на патогена в тествания материал;
  • нивото на ДНК (РНК) на патогена в тестовия материал е под границата на откриване.

Литература

  • Вовк Е.И., Машарова А.А. Остри чревни инфекции в практиката на спешния лекар. Терапевт. - М. 2002; 01-02: 58-62.
  • Инфекциозни заболявания при деца. Изд. Д. Мъри. - М.: Изд. "Практика". 2006:928.
  • Усенко Д.В., Плоскирева А.А., Горелов А.В. Остри чревни инфекции при деца в практиката на педиатър: възможности за диагностика и лечение. Въпроси на съвременната педиатрия. - М. 2014;13(3):12-20. http://www.spr-journal.ru/ojs/index.php/VSP/article/viewFile/340/682.
  • Pawlowski S.W., Warren C.A., Guerrant R. Диагностика и лечение на остра или персистираща диария. гастроентерология. 2009; 136 (6): 1874-1886.
Дял: